Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD2

C12orf66, KICSTOR complex protein C12orf66, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf66Q96MD2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C12orf66Q96MD2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C12orf66Q96MD2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C12orf66Q96MD2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C12orf66Q96MD2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C12orf66Q96MD2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C12orf66Q96MD2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C12orf66Q96MD2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C12orf66Q96MD2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
C12orf66Q96MD2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
C12orf66Q96MD2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C12orf66Q96MD2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C12orf66Q96MD2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C12orf66Q96MD2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C12orf66Q96MD2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C12orf66Q96MD2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C12orf66Q96MD2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C12orf66Q96MD2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C12orf66Q96MD2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C12orf66Q96MD2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C12orf66Q96MD2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C12orf66Q96MD2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C12orf66Q96MD2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C12orf66Q96MD2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
C12orf66Q96MD2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C12orf66Q96MD2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms