Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP53Q96M91 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms