Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2E2Q96LR5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms