Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MS4A4AQ96JQ5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms