Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CALML4Q96GE6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALML4Q96GE6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms