Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPL53Q96EL3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms