Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW1

AP2M1, AP-2 complex subunit mu, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2M1Q96CW1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP2M1Q96CW1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP2M1Q96CW1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP2M1Q96CW1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
AP2M1Q96CW1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP2M1Q96CW1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP2M1Q96CW1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP2M1Q96CW1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP2M1Q96CW1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP2M1Q96CW1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP2M1Q96CW1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP2M1Q96CW1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP2M1Q96CW1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP2M1Q96CW1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP2M1Q96CW1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP2M1Q96CW1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP2M1Q96CW1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP2M1Q96CW1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP2M1Q96CW1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP2M1Q96CW1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP2M1Q96CW1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP2M1Q96CW1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP2M1Q96CW1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP2M1Q96CW1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP2M1Q96CW1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP2M1Q96CW1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms