Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MKL1Q969V6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKL1Q969V6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms