Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCAMP4Q969E2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCAMP4Q969E2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCAMP4Q969E2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms