Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
USP7Q93009 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP7Q93009 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
USP7Q93009 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP7Q93009 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP7Q93009 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP7Q93009 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP7Q93009 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP7Q93009 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP7Q93009 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP7Q93009 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP7Q93009 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP7Q93009 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP7Q93009 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP7Q93009 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP7Q93009 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP7Q93009 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP7Q93009 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP7Q93009 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP7Q93009 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP7Q93009 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP7Q93009 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP7Q93009 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP7Q93009 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP7Q93009 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP7Q93009 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP7Q93009 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP7Q93009 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP7Q93009 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP7Q93009 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP7Q93009 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP7Q93009 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP7Q93009 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP7Q93009 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP7Q93009 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP7Q93009 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP7Q93009 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
USP7Q93009 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP7Q93009 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP7Q93009 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP7Q93009 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP7Q93009 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP7Q93009 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP7Q93009 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP7Q93009 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP7Q93009 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP7Q93009 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP7Q93009 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP7Q93009 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP7Q93009 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP7Q93009 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP7Q93009 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP7Q93009 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP7Q93009 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP7Q93009 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP7Q93009 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP7Q93009 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP7Q93009 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP7Q93009 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP7Q93009 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP7Q93009 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
USP7Q93009 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP7Q93009 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP7Q93009 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP7Q93009 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP7Q93009 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP7Q93009 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP7Q93009 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP7Q93009 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP7Q93009 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP7Q93009 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP7Q93009 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP7Q93009 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
USP7Q93009 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP7Q93009 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP7Q93009 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP7Q93009 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP7Q93009 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP7Q93009 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP7Q93009 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP7Q93009 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP7Q93009 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP7Q93009 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP7Q93009 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP7Q93009 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP7Q93009 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP7Q93009 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP7Q93009 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP7Q93009 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP7Q93009 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP7Q93009 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP7Q93009 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP7Q93009 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
USP7Q93009 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP7Q93009 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP7Q93009 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
USP7Q93009 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
USP7Q93009 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP7Q93009 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP7Q93009 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms