Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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C11orf40Q8WZ69 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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C11orf40Q8WZ69 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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C11orf40Q8WZ69 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C11orf40Q8WZ69 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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