Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GATAD2BQ8WXI9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms