Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HDAC7Q8WUI4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC7Q8WUI4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms