Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX29Q8TEQ0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX29Q8TEQ0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms