Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HELBQ8NG08 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HELBQ8NG08 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms