Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

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Length 486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM58Q8NG06 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM58Q8NG06 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM58Q8NG06 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM58Q8NG06 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM58Q8NG06 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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