Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA6DQ8NFY4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms