Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP35Q8NFH5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms