Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB37

GATD1, Glutamine amidotransferase-like class 1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATD1Q8NB37 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATD1Q8NB37 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms