Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNBD1Q8NA66 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNBD1Q8NA66 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNBD1Q8NA66 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNBD1Q8NA66 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNBD1Q8NA66 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNBD1Q8NA66 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNBD1Q8NA66 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNBD1Q8NA66 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CNBD1Q8NA66 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNBD1Q8NA66 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNBD1Q8NA66 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNBD1Q8NA66 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNBD1Q8NA66 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNBD1Q8NA66 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNBD1Q8NA66 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNBD1Q8NA66 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNBD1Q8NA66 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNBD1Q8NA66 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CNBD1Q8NA66 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CNBD1Q8NA66 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNBD1Q8NA66 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNBD1Q8NA66 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNBD1Q8NA66 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNBD1Q8NA66 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNBD1Q8NA66 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNBD1Q8NA66 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNBD1Q8NA66 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms