Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FSIP1Q8NA03 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FSIP1Q8NA03 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms