Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCL2Q8N4E4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms