Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC43Q8N309 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms