Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYCP3Q8IZU3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP3Q8IZU3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms