Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZI9

IFNL3, Interferon lambda-3, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL3Q8IZI9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNL3Q8IZI9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNL3Q8IZI9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNL3Q8IZI9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNL3Q8IZI9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNL3Q8IZI9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNL3Q8IZI9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFNL3Q8IZI9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFNL3Q8IZI9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFNL3Q8IZI9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFNL3Q8IZI9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFNL3Q8IZI9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFNL3Q8IZI9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFNL3Q8IZI9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFNL3Q8IZI9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFNL3Q8IZI9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFNL3Q8IZI9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFNL3Q8IZI9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFNL3Q8IZI9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
IFNL3Q8IZI9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFNL3Q8IZI9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFNL3Q8IZI9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFNL3Q8IZI9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFNL3Q8IZI9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFNL3Q8IZI9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFNL3Q8IZI9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFNL3Q8IZI9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFNL3Q8IZI9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFNL3Q8IZI9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFNL3Q8IZI9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms