Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SLFN12Q8IYM2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms