Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB11FIP4Q86YS3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
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