Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALYREFQ86V81 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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