Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW6

N4BP2, NEDD4-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP2Q86UW6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
N4BP2Q86UW6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
N4BP2Q86UW6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
N4BP2Q86UW6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
N4BP2Q86UW6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
N4BP2Q86UW6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
N4BP2Q86UW6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
N4BP2Q86UW6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
N4BP2Q86UW6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
N4BP2Q86UW6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
N4BP2Q86UW6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
N4BP2Q86UW6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
N4BP2Q86UW6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
N4BP2Q86UW6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
N4BP2Q86UW6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
N4BP2Q86UW6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
N4BP2Q86UW6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
N4BP2Q86UW6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
N4BP2Q86UW6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
N4BP2Q86UW6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
N4BP2Q86UW6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
N4BP2Q86UW6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
N4BP2Q86UW6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
N4BP2Q86UW6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
N4BP2Q86UW6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
N4BP2Q86UW6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
N4BP2Q86UW6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
N4BP2Q86UW6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
N4BP2Q86UW6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
N4BP2Q86UW6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
N4BP2Q86UW6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
N4BP2Q86UW6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
N4BP2Q86UW6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
N4BP2Q86UW6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
N4BP2Q86UW6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms