Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
KRT28Q7Z3Y7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT28Q7Z3Y7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms