Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3E2

CCDC186, Coiled-coil domain-containing protein 186, humanhuman

Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC186Q7Z3E2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC186Q7Z3E2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC186Q7Z3E2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC186Q7Z3E2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC186Q7Z3E2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC186Q7Z3E2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC186Q7Z3E2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC186Q7Z3E2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC186Q7Z3E2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC186Q7Z3E2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC186Q7Z3E2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC186Q7Z3E2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC186Q7Z3E2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC186Q7Z3E2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC186Q7Z3E2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC186Q7Z3E2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC186Q7Z3E2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC186Q7Z3E2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC186Q7Z3E2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC186Q7Z3E2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC186Q7Z3E2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC186Q7Z3E2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC186Q7Z3E2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC186Q7Z3E2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC186Q7Z3E2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC186Q7Z3E2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC186Q7Z3E2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC186Q7Z3E2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC186Q7Z3E2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC186Q7Z3E2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC186Q7Z3E2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC186Q7Z3E2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC186Q7Z3E2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms