Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CATSPER4Q7RTX7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CATSPER4Q7RTX7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CATSPER4Q7RTX7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CATSPER4Q7RTX7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CATSPER4Q7RTX7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CATSPER4Q7RTX7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CATSPER4Q7RTX7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CATSPER4Q7RTX7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CATSPER4Q7RTX7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CATSPER4Q7RTX7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CATSPER4Q7RTX7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CATSPER4Q7RTX7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CATSPER4Q7RTX7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CATSPER4Q7RTX7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CATSPER4Q7RTX7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CATSPER4Q7RTX7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CATSPER4Q7RTX7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CATSPER4Q7RTX7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CATSPER4Q7RTX7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CATSPER4Q7RTX7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CATSPER4Q7RTX7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CATSPER4Q7RTX7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CATSPER4Q7RTX7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CATSPER4Q7RTX7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CATSPER4Q7RTX7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CATSPER4Q7RTX7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CATSPER4Q7RTX7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CATSPER4Q7RTX7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CATSPER4Q7RTX7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CATSPER4Q7RTX7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms