Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP31Q70CQ4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms