Protein–RNA interactions for Protein: Q709F0

ACAD11, Acyl-CoA dehydrogenase family member 11, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD11Q709F0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACAD11Q709F0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACAD11Q709F0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms