Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM43BQ6ZT52 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM43BQ6ZT52 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms