Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
LRRC9Q6ZRR7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC31.89■■■□□ 2.7
LRRC9Q6ZRR7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
LRRC9Q6ZRR7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
LRRC9Q6ZRR7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC31.88■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
LRRC9Q6ZRR7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
LRRC9Q6ZRR7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
LRRC9Q6ZRR7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
LRRC9Q6ZRR7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
LRRC9Q6ZRR7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
LRRC9Q6ZRR7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
LRRC9Q6ZRR7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
LRRC9Q6ZRR7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
LRRC9Q6ZRR7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
LRRC9Q6ZRR7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
LRRC9Q6ZRR7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
LRRC9Q6ZRR7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
LRRC9Q6ZRR7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
LRRC9Q6ZRR7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms