Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSMFQ6X4W1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSMFQ6X4W1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms