Protein–RNA interactions for Protein: Q6V0L0

CYP26C1, Cytochrome P450 26C1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26C1Q6V0L0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP26C1Q6V0L0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP26C1Q6V0L0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP26C1Q6V0L0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP26C1Q6V0L0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP26C1Q6V0L0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP26C1Q6V0L0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP26C1Q6V0L0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP26C1Q6V0L0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP26C1Q6V0L0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP26C1Q6V0L0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP26C1Q6V0L0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP26C1Q6V0L0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP26C1Q6V0L0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP26C1Q6V0L0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP26C1Q6V0L0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP26C1Q6V0L0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP26C1Q6V0L0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP26C1Q6V0L0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP26C1Q6V0L0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP26C1Q6V0L0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP26C1Q6V0L0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP26C1Q6V0L0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP26C1Q6V0L0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP26C1Q6V0L0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP26C1Q6V0L0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP26C1Q6V0L0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP26C1Q6V0L0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP26C1Q6V0L0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP26C1Q6V0L0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms