Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXT8

ALKAL1, ALK and LTK ligand 1, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKAL1Q6UXT8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALKAL1Q6UXT8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALKAL1Q6UXT8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALKAL1Q6UXT8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALKAL1Q6UXT8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALKAL1Q6UXT8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALKAL1Q6UXT8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALKAL1Q6UXT8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALKAL1Q6UXT8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALKAL1Q6UXT8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALKAL1Q6UXT8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALKAL1Q6UXT8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALKAL1Q6UXT8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALKAL1Q6UXT8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALKAL1Q6UXT8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ALKAL1Q6UXT8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALKAL1Q6UXT8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALKAL1Q6UXT8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ALKAL1Q6UXT8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALKAL1Q6UXT8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALKAL1Q6UXT8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALKAL1Q6UXT8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALKAL1Q6UXT8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALKAL1Q6UXT8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALKAL1Q6UXT8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALKAL1Q6UXT8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALKAL1Q6UXT8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ALKAL1Q6UXT8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALKAL1Q6UXT8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms