Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMARCD3Q6STE5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMARCD3Q6STE5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMARCD3Q6STE5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMARCD3Q6STE5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMARCD3Q6STE5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMARCD3Q6STE5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMARCD3Q6STE5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMARCD3Q6STE5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms