Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RWDD4Q6NW29 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.33■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms