Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRNP1Q6NT89 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms