Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPH2Q6IBW4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAPH2Q6IBW4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms