Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPECC1LQ69YQ0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms