Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC102BQ68D86 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC102BQ68D86 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC102BQ68D86 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC102BQ68D86 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC102BQ68D86 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC102BQ68D86 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC102BQ68D86 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC102BQ68D86 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC102BQ68D86 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC102BQ68D86 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC102BQ68D86 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC102BQ68D86 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC102BQ68D86 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC102BQ68D86 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC102BQ68D86 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC102BQ68D86 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC102BQ68D86 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC102BQ68D86 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC102BQ68D86 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC102BQ68D86 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC102BQ68D86 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC102BQ68D86 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC102BQ68D86 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC102BQ68D86 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC102BQ68D86 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC102BQ68D86 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC102BQ68D86 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC102BQ68D86 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC102BQ68D86 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC102BQ68D86 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC102BQ68D86 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC102BQ68D86 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC102BQ68D86 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC102BQ68D86 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC102BQ68D86 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC102BQ68D86 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC102BQ68D86 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms