Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E4F1Q66K89 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms