Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRAGBQ5VZM2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms