Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 AC022087.1-201ENST00000558372 612 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 AC068985.1-201ENST00000463297 703 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 QTRT2-209ENST00000479882 1196 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 AC055748.1-201ENST00000489836 959 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
CHIC1Q5VXU3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms