Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOGA3Q5TF21 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOGA3Q5TF21 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms