Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF3Q5SZQ8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms